Warren's Blog

看论文的时候看到了这个方法，由于不懂就去学习了一下，顺带浅浅做了点笔记。

在群体遗传学中，连锁不平衡是一个很重要的概念。前段时间看论文的时候看到了这个概念，于是专门花了点时间重温了一下相关知识点，顺带浅浅做了点笔记。

如题。

如题。

U.S. News世界大学排名是全球最知名且具有广泛影响力的大学排名之一，由美国《美国新闻与 世界报道》（U.S. News & World Report）发布。自1983年起，U.S. News开始对美国大学进行 排名，随着时间的推移，这一排名体系逐渐扩展到全球范围，成为衡量大学学术水平和综合影响力的重要参考。前几天他们发布了今年最新版的大学排名，感觉需要关注一下。

Termux是一个在安卓设备上模拟Linux终端的APP。借助这个终端，可以运行许多Linux程序；更进一步的，我们还可以在其上安装发行版并配置桌面环境，进而运行一些PC端应用（在华为最新的几款平板上，这个功能叫做“PC应用引擎”）。下面是探索的步骤

前段时间正好高考，和往年一样关于高考的讨论占据了那几天话题的顶流——这当然也包括对高考制度的反思。当时我关注的几个心理学方面的公众号都发布了征集令或者采访（例如《高考曾给你留下怎样的心理创伤？》），对高考带来的创伤进行了一些探讨。

由于工作需要，我要在一个docker环境中安装一个mysql，于是对docker和mysql做了一点探究，笔记如下。

又是一年520。

虽然今年此时依旧单身，但或许还是可以讨论点爱情相关的内容。几天前，看完了马尔克斯的一部小说《霍乱时期的爱情》，有了一些想法，正好放在520这个大背景下谈一谈。

2022年底，openai发布了chatGPT这一通用对话式大语言模型，之后的2023年，通用大语言模型进入井喷式发展阶段。在国外，openai（以及微软）、谷歌、meta、Anthropic AI 等公司先后发布自己的闭源或开源的大模型，而国内的互联网大厂也赶上了这一波浪潮，发布了许多面向国内市场的新产品。在这些公司中，最早出圈的百度文心一言，现在则有阿里通义千问、腾讯混元、字节豆包、讯飞星火等一系列大模型产品可供挑选。

这些产品大部分都可以通过浏览器免费访问它们的网页版。然而在一些场景中，使用浏览器可能并不现实（例如在一些低性能电脑上，或者在服务器命令行场景当中——在后一种场景下，我们能交互的只有命令行界面）。幸运的是，我们还可以通过API调用这些大模型。

在世界范围内，GPT-4、Claude-3等国外公司的产品已经远远走在了领域前列，然而受限于跨国访问的网络不稳定，在本文教程中我们更倾向于使用国内互联网公司的产品。我们将介绍如何基于python编程语言和通义千问的API打造一款命令行chatbot工具，并结合百度网页搜索以及beautifulsoup4库实现信息在线查询的功能。

一直很喜欢《别赋》中的几句诗：“或乃边郡未和，负羽从军。辽水无极，雁山参云。闺中风暖，陌上草薰”。北京作为首都，兼顾着北方军事重镇的职能，而北京西部和北部连绵不绝的群山，更是照应着“雁山参云”的辽阔雄浑。刚刚过去的五一假期，我开启了一趟特殊的北京天津特种兵之行。

本文简单介绍了可解释机器学习的研究背景，并结合python的sklearn接口简单探索了一些实现事后机器学习可解释性的方法。这些方法将对实际应用中的数学模型搭建和分析起到重要的作用。

四月天正是春光明媚的时节，和煦的暖风让人非常舒服。

2023年8月左右，微软对OneNote Web Clipper插件进行了更新——然而并不是什么好更新，而是弹出一个“OneNote Web Clipper is no longer supported on Firefox browser”的提示然后自动卸载的更新，逼着用户换Edge浏览器。

本测试仅供参考，不作为诊断依据。

三月的最后一天。

“eGPS软件平台的MAF插件无法正确处理gzip格式输入数据问题。”

寒假那段时间，实验室的一位师姐不知道从哪里弄来了一颗郁金香的球茎，种在了实验室的阳台上。按照郁金香的花期，这段时间它应该已经开出了花——可是并没有，那颗可怜的球茎只是一味的长叶子，长得长长的就跟蒜苗一样高，甚至连个花苞都没打，一点开花的迹象都没有。

在排除了光照（实验室光线很充足）、营养（应该不缺吧？）、水分（可充足了）等影响因素之后，这颗球茎不开花的最大可能原因就是温度了。查询了一些种植经验帖，发现很多人提到郁金香需要冷藏一个星期左右的时间再来种植，因为郁金香等植物确实需要春化作用才能开花。师姐承认她没有做这一步处理，也许正是这个原因导致郁金香没有开花。

于是利用空闲时间，查了一下植物的春化作用的相关知识点。

在RNA-seq数据的分析流程中，基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA）是一种很常用的下游分析方法。这一方法在2005年由MIT博德研究所开发，用于确定先验定义的基因集（如特定信号通路的编码基因、疾病性状的关联基因等）是否在基因表达差异分析的结果上出现统计学显著性。

因为课题的原因，最近再一次复习了一下GSEA方法。目前有许多工具都能进行GSEA分析，例如博德研究所官方提供了一个基于Java编程语言开发的GSEA计算工具 ，南方医科大学的余光创教授开发的R语言工具包ClusterProfiler也提供了GSEA分析的功能。本文将简单介绍一下GSEA的原理，并举例说明如何使用博德研究所官方的工具包做GSEA分析。

这一周事情有点多。（开学后这段时间的摆烂造成了严重后果，组会后的心情十分低落。）

周末没有抽出太多时间探索新的知识，谨在此po一篇去年整理的旧文。

如题。

前些天，在电脑上安装R包时碰见了一个问题：

1
2
3
4
5
6

> install.packages("FastEPRR_2.0.zip")
inferring 'repos = NULL' from 'pkgs'
package 'FastEPRR' successfully unpacked and MD5 sums checked
> library(FastEPRR)
Error: package or namespace load failed for 'FastEPRR':
 package 'FastEPRR' was installed before R 4.0.0: please re-install it

根据报错提示，应该是我们用的R包版本比较老所导致的不兼容问题。这个R包并非官方CRAN上的包，而是实验室自己开发并封装的计算工具包，因此只有离线安装这一种安装方法，并且这个包的版本只与R 3.x.x版本兼容，低于系统里装的R 4.3.1版本。

下面是一些探索。

上周的文章中，我们介绍了几种Linux上的文件共享策略，并提到了可以用systemctl将程序注册为系统服务。本篇将主要介绍一下注册为系统服务的具体方法。

如题。

上一节中，我们介绍了几种跨设备的文件传输方案，其中提到了坚果云webDAV服务。鉴于坚果云的存储空间有限，为了获得更好的使用体验，本篇我们将要介绍在Linux云服务器上自建webDAV网盘服务的方法。

碎碎念。

刚放寒假那几天，有位朋友问了我一个问题： 有什么不限制文件格式的、基于网络的文件互传/同步工具或云储存，以便于代码/文档/图片等在不同设备之间的共享？ 这个问题之前没有仔细研究过，模模糊糊也只是知道有一些技术可以实现这样的文件共享，于是想着专门学习一下。然而，寒假期间除了休息和给长辈帮忙，就没怎么给学习留下时间。这不，趁着寒假快要结束，刚好抽出点时间来探索一下这个问题。

整理了一些云存储的通信协议。

如题。

有时候我们可能会有在无电脑的情况下开发和运行程序的需求。这个时候，可以使用本文提到的终端程序进行一些程序开发的操作。

这几天放假回家了。

具体来说，是昨天中午到的家。

如题。

如题。

原先的服务器快到期了，因此这周初新购进一台华为云的服务器。在配置服务器的时候，顺带温习了一下这些知识点。

R语言有save()和save.image()方法，可以保存整个工作区的镜像，用于下一次的使用。这个功能非常方便，可以节省调试过程中生成中间变量的时间。

那么python可以吗？

通过R安装了TinyTeX这一LaTeX发行版，并探索了用其编译jupyter notebook的方法。

本周更新了一篇技术文章。此外，对网站进行了一些调整，新增了文章搜索的功能。

“简单来说，normal模式中按下字母q进入录制模式，此时的操作会被记录。再次按下q录制完成。要执行已录制好的宏，只需要键入n@a即可，其中n是执行次数，a是宏名称”

一些搜索指令。

本文对pypy解释器进行了一些介绍

dataframe是统计学研究中经常使用的一种数据格式，最早在R语言上实现。python作为后起之秀，通过pandas这一模块也实现了对dataframe的支持。那么，这两种不同编程语言的dataframe又有什么区别呢？二者之间能否实现数据互通呢？本文将回答这些问题。

本文介绍了 AppImage格式，并连带介绍了几种别的打包方式。

如题。

本文转载自互联网，介绍了R语言从S3到R6的对象系统特性和使用方法。

没有一个冬天不可逾越，没有一个春天不会来临。

原文地址：
《剪贴板操作 Clipboard API 教程》 - 阮一峰

Git是一个开源的分布式版本控制系统，它可以有效、高速地处理从小到大的任何项目。

本文将从Git的诞生、原理、使用方法、分支与合并功能以及与GitHub的关系等方面对其进行简要介绍。

本周对博客中的一些历史文章缺失的图片进行了修补，此外对博客页面的外观进行了一点点微调——现在的卡片比之前更圆润了。

这一周更新了三篇文章：《obsidian探索小记（三）——与flomo笔记的联动》《常见服务器作业管理系统》《使用Python的SymPy库求解不定积分》。前两篇文章来自和同学交流中收集到的一些话题，而最后一篇文章来源于科研生活，某天师姐在推导公式时遇到的一个问题。

对obsidian笔记软件的继续探索。

如题。本文是对几种服务器作业管理系统的简要介绍。

如题。

本文介绍了vscode代码编辑器配置远程服务器插件的方法。