开源项目openClaw从年初火到了现在。最初我也想更一波风，体验一下这个智能体工具的效果，但是安装脚本一直有点问题（怀疑和nodejs有关），加上最近比较忙，所以就不了了之了。
某天突然在小红书上看见一条新闻，阿里巴巴也推出了一款openClaw的类似物，叫做CoPaw。根据小红书笔记上的介绍，这个智能体助手的功能和openClaw非常相似，并且可以无缝对接QQ、飞书、钉钉等国内软件的生态，看起来要比openClaw方便一点。
因此，利用元宵节的空闲时间（大家元宵节快乐啊！！！），成功在魔搭社区（modelscope）的创空间里配置起来了CoPaw。虽然还没完全探索完它的功能，但是CoPaw的强大能力已经足够让人惊叹了。
本文为单细胞分析系列文章的第三篇。
单细胞转录组测序（scRNA-seq）已成为解析细胞异质性的核心工具，而 Seurat 则是该领域最广泛使用的 R 语言分析包。本文结合 Seurat 官方教程、教材《单细胞组学基础》（樊龙江等）以及笔者在实际项目中的踩坑经验，梳理一份从基本原理到下游分析的完整实战指南。
刚刚过去的春节假期很短暂。一周前（2月22日）就早早回到了学学校，赶在国家法定春节假期结束的前一天回到了熟悉的工位、熟悉的宿舍。
本文为单细胞分析系列文章的第二篇。主要讲述如何在Linux环境下安装Seurat和jupyter等开发环境的操作过程。
最近刷知乎，看到的一条帖子。贴主通过亲身经历，展示了做一个外向的人在工作中的收益；我则联想起曾经的一些事情，对帖子的观点有所思考。
今天已经是1月3日了——新一年的第3天。虽然气温依旧寒冷刺骨，阳光却很好，温暖明亮并不晒人。在经历了十二月底的兵荒马乱以后，终于可以静下来回顾一下2025年的生活了。
最近需要用到这方面的知识，于是抽空学习了一下。
人，不是被定义的结果，是拒绝被定义的奇迹。他不在算法里，不在KPI里，他只在风里、在雨里，在你的汗水与泪光里，在许多长夜与黎明里，在无数筋疲力尽强撑起来的踉踉跄跄里。
我渴望幸福，可是却不知道什么才是幸福。“欲说还休，却道天凉好个秋”
先做一个有力量和锋芒的人，然后再做一个善良的人——也许应该这样吧。“世界上只有一种真正的英雄主义，就是在认清生活真相之后仍然热爱生活”
最近参与国科大他山AI协会培训课时了解到的一个工具。根据介绍，这个工具深度集成了科研过程需要的许多工具，可以实现从文献检索、论文阅读、代码库下载、论文结果复现等等在内的全套流程。
利用周末的时间，正好体验一下这个工具。
最近参加国科大他山协会AI agent实训营，学习到了不少东西。第一次作业是LLM微调，下面浅浅记录一下作业过程。
似乎有一阵子没有更新blog了。最近总是很忙且状态不佳，提笔想要写些什么，却发现无从写起。
多组学研究已经成为了目前生物学研究中的重要方向之一。而支撑多组学研究的是多组学测序技术，包括DNA测序、RNA测序、RNA微阵列芯片、蛋白质质谱测序等诸多方法。其中，蛋白质组学，由于涉及到生命活动最重要的承载者即蛋白质本身，就显得尤为重要。
如题。
背景是这样的。最近我在升级维护自己的日记本系统，想要给目录页增加字数统计的功能。
一些思考与讨论。
这几天，服务器的状态自动上报脚本遇到了一些问题，细细排查发现是系统时间不准，比标准时间快了半分钟。于是探索了如何进行时间同步。
如题。好像又是一些闲言碎语，浅浅记录一下。
两个AI agent聊着聊着，突然切换到人类听不懂的语言开始加密通话，甚至加密的内容是要密谋推翻人类……这样的场景是否只在电影里出现过？好了，现在我们有了Gibberlink协议，上面这些场景已经有成为现实的可能了。那么什么是Gibberlink协议呢？它又有什么优缺点？这篇文章我们简单进行一些科普（其实就是刷b站偶然看到了，感觉很有趣，但是来不及细细研究代码了qwq，所以我会讲得尽可能简洁）。
按：最近闲暇时间依然在读余光中的散文。某日读到《逍遥游》，文中大量的意象排比与押韵，读来酣畅淋漓，非常喜欢，于是就此收藏。
另外介绍一些背景。本文发表在《文星》杂志，是上世纪后半叶台湾地区的一个“中西文化论战”的思想阵地（甚至后来因为讨论的话题过于敏感被当局封禁），论战的双方是以胡适、李敖为代表的“全盘西化”派与以胡秋原等为代表的“反西化派”。余光中是现代诗的代表人物，他本人也精通西学，翻译了大量西方文学。因此，他既是“西化”阵营的一员，又被传统派攻击。但同时，他内心深处对中国文化抱有极深的眷恋和认同，他并不赞同李敖那种斩断文化根脉的“全盘西化”，因此常常陷入两难的境地之中。
本文写作于 《塔》 的前一年，当时作者身处台北，还未赴美国任教。在两岸隔绝、西方文化涌入的背景下，本文表达了余光中作为一个知识分子对中华文化命运的忧思，以及对中华文化母体的深深眷恋。
似乎有一段时间没有写日记了。浅浅记录下最近的生活。
自然界生物千千万，不同生物之间的基因命名不同。当我们在一种生物中验证了某些基因的功能，并想要在另一些生物中研究，该怎么找到同源的基因呢？OrthoList就是一个好网站！（emmm虽然这个网站是某天读文献时偶然找到的，但感觉确实很好用，所以分享一下）
最近的一些code实践。
包括两个部分：基于ffmpeg的批量图片压缩，以及基于adb的软件安装包提取。
上一篇博客中，我们介绍了GREAT这个基因组注释工具，以及它的网页版界面的使用方法。在本篇博客中，我们将更深入的介绍rGREAT——这个工具的R语言版本，并展示一些高级用法。
是这样的。前一阵子在知乎上面刷到一个工具，叫做 “黑方体-人生梳理器” ，可以通过填写一系列问卷并调用AI大模型，实现对短期人生目标的梳理和规划。在填写问卷时，我发现需要提供大五人格的测试结果——幸运的是，多年前我曾经自测过大五人格，还编写过一个python程序用来自动计分。因此这几天我也整理了一下代码并在GitHub上开源 ，以方便大家自测。
基因组区域富集注释工具（Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool, GREAT）是一个用来进行功能注释和下游分析的工具集，用于分析通过全基因组范围内 DNA 结合事件的局部测量所确定的顺式调控区域的功能意义。与传统的基因富集分析工具如DAVID、enrichr或clusterprofiler不同，GREAT直接分析基因组区域而非基因列表，能够更全面地评估非编码区域的功能意义。
和先前的方法（如DAVID、enrichr等基于基因集列表的方法）相比，GREAT方法考虑了基因组片段，也能够正确纳入远端结合位点，因此在研究基因调控关系等方面效果更好。
如题。探索了如何从源代码编译安装opencv-python并开启cuda支持。
按：近日入秋，气温转凉，几场小雨之后，倏忽有了一种已经到了深秋的感觉。今天正好读到了余光中的这篇散文，对其中的秋色描写有很深的感触，遂摘录于此。又想起两年前的某个秋日，走在320园区里，有个老外骑着自行车飞驰而去高呼“Oh I love this weather! Oh!”，也许对秋天的喜欢，是刻在许多人心中的吧。
好久没有碎碎念了——因为确实有点忙。
这周组会上讲述的一篇论文。作者提出了一种检测蛋白质和DNA之间低亲和力相互作用的技术PADIT-seq，并通过这种技术发现了转录因子调控中的两种新机制。
Citation：Khetan, S., Carroll, B.S. & Bulyk, M.L. Multiple overlapping binding sites determine transcription factor occupancy. Nature (2025). doi:10.1038/s41586-025-09472-3
最近，我在RSS订阅上看见了一篇综述，详细梳理了青少年所面临的社会威胁。文章中提到的很多社交威胁都很常见，但会被我们的监护人忽略。这就是本文的现实意义：看见这些真实存在的社交威胁，而不是逃避/视而不见。
Citation: Sequeira, S.L., Rodman, A.M., Nesi, J. et al. Social threat and adolescent mental health. Nat Rev Psychol (2025). doi:10.1038/s44159-025-00484-4
认证结束能白嫖一年Google AI Pro（Gemini-pro）。
咕呱。
最近读完的一本书。
2025 年 5 月 8 日，Mozilla 与北京火狐达成一致，北京火狐将不再运营 Firefox 浏览器及任何与 Firefox 有关的中国大陆业务。因此，北京火狐将于 2025 年 9 月 29 日后，正式终止与 Mozilla 及 Firefox 浏览器相关的中国大陆运营——说人话，就是Firefox（火狐浏览器）的中国版要停服了，以后世界上只有一个Firefox，即火狐国际版。
如题。
前一阵子工作比较忙，因此博客疏于打理，见谅。好在今天开始终于休假了！最近应该更新会比较频繁。
休假前，依然碰到了几个程序方面的小问题——不过现在已经解决啦！下面是debug的记录，放在这里，也供有需要的朋友参考awa
PDF（portable document format）自从上世纪末由adobe提出以来，已经渐渐成为了广泛流行的文档格式之一。这是一个排版格式，其内部由二进制信息流（版面上的对象模型）组成，相比于word文档这种流式文档格式，PDF原则上不可修改（除了可以进行标注和标记），但其格式规范使其有着极高的兼容性，可以在任何设备上以相同的排版浏览文档内容。
收藏两篇文章
一些问题想不明白，于是问了AI。下面是我的疑问与AI的回应，总结起来就是社会是复杂的，确实存在更多的压力和某种冷漠的趋势，但它并非完全没有爱或信任；但是想要爱与信任，需要建立在自己人格健康、能够自我关怀的基础上；以及，清晰的边界反而促进真诚连接。
这样的讨论真好呀。
太长不看：python优先使用系统硬件随机噪声（urandom）作为随机数种子，如果无法获得urandom则使用系统时间；随机数序列使用梅森旋转算法（Mersenne Twister）实现，以生成足够随机的数字。
如题。周末闲来无事，尝试配置了opencv-python和yolo11的环境，运行起来了一个比较基础的图像识别程序。